MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 2422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022118	GCC	2	6	4	9	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_022118	TGC	2	6	63	68	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022118	ATT	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022118	CGA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022118	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022118	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022118	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022118	GAA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022118	AGA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022118	AGA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022118	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022118	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022118	TTG	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022118	CTC	2	6	614	619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_022118	GAT	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022118	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022118	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022118	ATG	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022118	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022118	CCT	2	6	952	957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_022118	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022118	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022118	TGA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022118	A	6	6	1203	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022118	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022118	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022118	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022118	T	7	7	1247	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022118	A	6	6	1258	1263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022118	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022118	T	6	6	1639	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022118	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022118	T	7	7	1661	1667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022118	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022118	A	6	6	1733	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022118	GCA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022118	A	6	6	5066	5071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022118	AGA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022118	CAAAAA	2	12	6250	6261	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022118	GGAG	2	8	6304	6311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022118	CTT	2	6	6360	6365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022118	TATG	2	8	6953	6960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022118	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022118	A	6	6	7011	7016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022118	TATTT	2	10	7032	7041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022118	ATG	2	6	7237	7242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022118	A	6	6	9130	9135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022118	TTC	3	9	9175	9183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022118	ATC	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022118	A	6	6	9215	9220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022118	GAA	2	6	9229	9234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022118	A	6	6	9285	9290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022118	TATT	2	8	9309	9316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022118	CCT	2	6	9330	9335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_022118	AG	3	6	9351	9356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022118	TAG	2	6	11193	11198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022118	AGAA	2	8	11203	11210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022118	CTT	2	6	11243	11248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022118	TA	3	6	11249	11254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022118	TCA	2	6	11280	11285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022118	TA	3	6	13340	13345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022118	ATT	2	6	13374	13379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022118	AAG	2	6	13391	13396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022118	TTA	2	6	13417	13422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022118	AAGG	2	8	13439	13446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022118	AAG	2	6	13451	13456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022118	AAC	2	6	13535	13540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022118	TA	4	8	13564	13571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022118	CTT	2	6	14958	14963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022118	CAAA	2	8	16073	16080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_022118	AG	3	6	17516	17521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022118	GA	3	6	17529	17534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022118	GTT	2	6	17631	17636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022118	AGA	2	6	18377	18382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022118	CTT	3	9	19893	19901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022118	T	6	6	19900	19905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022118	T	6	6	19907	19912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022118	GAA	2	6	20418	20423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022118	A	6	6	20480	20485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022118	AG	3	6	20517	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022118	A	6	6	20555	20560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022118	GGA	2	6	20612	20617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022118	AGA	3	9	20652	20660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022118	GA	3	6	20675	20680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022118	TGG	2	6	20871	20876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022118	AAC	2	6	20910	20915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022118	AGC	2	6	20927	20932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022118	GCCA	2	8	21021	21028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_022118	TGA	2	6	21128	21133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022118	AG	3	6	21192	21197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022118	TCC	2	6	21245	21250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_022118	CT	3	6	21261	21266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022118	CGCT	2	8	21269	21276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022118	TTAA	2	8	21290	21297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022118	GTTA	2	8	21327	21334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022118	GATC	2	8	21382	21389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_022118	AAT	2	6	21421	21426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022118	A	7	7	24561	24567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022118	TTA	2	6	24574	24579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022118	T	9	9	24589	24597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022118	GA	3	6	26513	26518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022118	CT	3	6	26520	26525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_022118	ACT	2	6	26528	26533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022118	A	6	6	26544	26549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022118	T	7	7	26556	26562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022118	T	7	7	27870	27876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022118	TAA	2	6	27881	27886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022118	TC	3	6	27888	27893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022118	ATTG	2	8	27939	27946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022118	AG	3	6	27971	27976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022118	AGA	2	6	27993	27998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022118	AAAGA	2	10	33093	33102	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022118	CTG	2	6	33122	33127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022118	GA	3	6	36384	36389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022118	T	9	9	36418	36426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022118	CTT	2	6	36478	36483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022118	AT	3	6	36486	36491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022118	CT	3	6	38753	38758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022118	TAA	2	6	38816	38821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022118	T	6	6	38836	38841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022118	AAG	2	6	38857	38862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022118	A	8	8	40114	40121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022118	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022118	T	6	6	40129	40134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022118	CTC	2	6	40135	40140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_022118	AAG	2	6	40220	40225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022118	T	8	8	40310	40317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022118	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022118	TGCAA	2	10	42327	42336	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_022118	A	6	6	42581	42586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022118	GA	5	10	42591	42600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022118	A	7	7	42630	42636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022118	CAAAA	2	10	42645	42654	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022118	A	7	7	42651	42657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022118	GAT	2	6	42675	42680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022118	AAG	2	6	42681	42686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022118	AG	3	6	42715	42720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022118	A	6	6	42721	42726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022118	GGA	2	6	42733	42738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022118	TAA	2	6	42831	42836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022118	TC	3	6	43807	43812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_022118	TGTT	2	8	43816	43823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022118	A	8	8	43855	43862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022118	AATA	2	8	44055	44062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022118	ACT	2	6	44063	44068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_022118	AAG	2	6	45914	45919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022118	GCA	2	6	45924	45929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_022118	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022118	TGT	2	6	48062	48067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022118	T	8	8	48608	48615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022118	GTC	2	6	48740	48745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_022118	AAG	2	6	48762	48767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022118	TAT	2	6	48791	48796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022118	T	8	8	48885	48892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022118	A	6	6	48936	48941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022118	T	6	6	49046	49051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022118	AGA	2	6	49561	49566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022118	CTATT	2	10	49590	49599	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_022118	AAG	2	6	49623	49628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022118	TCT	2	6	49637	49642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_022118	T	7	7	49698	49704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022118	AAT	2	6	49713	49718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022118	TGT	2	6	49735	49740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_022118	GCC	2	6	49782	49787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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167	NC_022118	ATTAA	2	10	51381	51390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022118	TG	4	8	51391	51398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022118	TAA	2	6	51408	51413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022118	T	6	6	51432	51437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022118	AGT	3	9	51476	51484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022118	GAT	2	6	52129	52134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022118	T	6	6	52173	52178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_022118	AAG	2	6	52207	52212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_022118	AAT	2	6	52234	52239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_022118	ATT	2	6	52246	52251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_022118	T	6	6	53232	53237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_022118	T	6	6	53247	53252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_022118	TGTT	2	8	54048	54055	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_022118	T	6	6	57336	57341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_022118	CTT	2	6	57352	57357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_022118	T	6	6	59045	59050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_022118	T	7	7	60881	60887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_022118	AAAAAT	2	12	60889	60900	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_022118	G	6	6	67417	67422	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_022118	TGA	2	6	93453	93458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_022118	A	6	6	93994	93999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_022118	TAA	2	6	94074	94079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_022118	CTTTT	2	10	94164	94173	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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280	NC_022118	T	7	7	94194	94200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_022118	T	9	9	94222	94230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_022118	ATT	3	9	94292	94300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_022118	T	6	6	94314	94319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_022118	T	6	6	94321	94326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_022118	A	6	6	94330	94335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_022118	CAATC	2	10	96505	96514	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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288	NC_022118	T	6	6	97676	97681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_022118	TATT	2	8	97687	97694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_022118	ACAAA	2	10	97710	97719	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
291	NC_022118	A	6	6	97717	97722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_022118	A	6	6	97748	97753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_022118	TTA	2	6	97765	97770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_022118	AAT	2	6	99535	99540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_022118	T	6	6	99972	99977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_022118	AT	3	6	99979	99984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_022118	GAA	2	6	99988	99993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_022118	T	6	6	185629	185634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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